Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv15A0A0A6YYE3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trbv15A0A0A6YYE3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv15A0A0A6YYE3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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