Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CDKN3Q16667 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDKN3Q16667 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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