Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GRIK2Q13002 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms