Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3AQ14563 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms