Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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TCOF1Q13428 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TCOF1Q13428 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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