Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CNTN1Q12860 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CNTN1Q12860 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CNTN1Q12860 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CNTN1Q12860 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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