Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERGIC2Q96RQ1 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERGIC2Q96RQ1 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERGIC2Q96RQ1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERGIC2Q96RQ1 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ERGIC2Q96RQ1 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ERGIC2Q96RQ1 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERGIC2Q96RQ1 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms