Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CSNK2A3Q8NEV1 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CSNK2A3Q8NEV1 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CSNK2A3Q8NEV1 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CSNK2A3Q8NEV1 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CSNK2A3Q8NEV1 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSNK2A3Q8NEV1 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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