Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CLPPQ16740 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CLPPQ16740 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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