Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SP140Q13342 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SP140Q13342 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SP140Q13342 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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