Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KNOP1Q1ED39 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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