Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SHHQ15465 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SHHQ15465 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SHHQ15465 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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