Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNTN1Q12860 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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