Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HOXD10P28358 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms