Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ZNF248Q8NDW4 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZNF248Q8NDW4 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms