| RUNX2 | Q13950 | MIR412-201 | ENST00000362142 | 91 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR51A4-201 | ENST00000380373 | 1002 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP219-201 | ENST00000390940 | 113 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160162.1-202 | ENST00000417654 | 244 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL645937.1-202 | ENST00000421799 | 937 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018495.1-201 | ENST00000440266 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000936.1-201 | ENST00000442124 | 483 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL37P4-201 | ENST00000448908 | 268 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC115115.1-201 | ENST00000449927 | 248 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BX510359.1-201 | ENST00000456973 | 237 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092919.1-201 | ENST00000467896 | 229 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC083904.1-201 | ENST00000487828 | 231 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCXD2-AS1-201 | ENST00000493131 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110794.1-201 | ENST00000505816 | 425 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097467.3-212 | ENST00000512269 | 568 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.17-201 | ENST00000517184 | 124 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA20.6-201 | ENST00000517251 | 106 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM92A-209 | ENST00000519679 | 538 nt | TSL 4 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104027.1-201 | ENST00000521887 | 300 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02300-201 | ENST00000549742 | 665 nt | TSL 4 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026462.2-201 | ENST00000565771 | 286 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC106782.4-201 | ENST00000568264 | 210 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5680-201 | ENST00000577577 | 84 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P15-201 | ENST00000585707 | 270 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018638.8-201 | ENST00000588755 | 281 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01928-201 | ENST00000591029 | 504 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098617.1-215 | ENST00000594798 | 1152 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092747.3-201 | ENST00000603769 | 301 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4LP5-201 | ENST00000605152 | 292 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021646.1-201 | ENST00000605469 | 484 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMAD5-AS1_1.1-201 | ENST00000619886 | 266 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC244517.5-202 | ENST00000623741 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091903.1-201 | ENST00000624322 | 454 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100810.6-201 | ENST00000638068 | 285 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPIP5K2-203 | ENST00000414217 | 5842 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110491.1-201 | ENST00000562191 | 2010 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABRG2-221 | ENST00000639683 | 3600 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP2C1-202 | ENST00000359644 | 3401 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AKAP7-209 | ENST00000541650 | 2008 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.279-201 | ENST00000364763 | 95 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-876P-201 | ENST00000391295 | 104 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA48.8-201 | ENST00000391324 | 134 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EIF4EBP2P3-201 | ENST00000403144 | 334 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162578.1-201 | ENST00000406202 | 378 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.623-201 | ENST00000411128 | 95 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARL5AP1-201 | ENST00000418991 | 388 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162726.4-201 | ENST00000422010 | 673 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4LP11-201 | ENST00000422184 | 280 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353729.1-201 | ENST00000425044 | 720 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007271.1-201 | ENST00000428188 | 382 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC117503.1-201 | ENST00000472241 | 394 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM206BP-201 | ENST00000510179 | 541 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010265.1-201 | ENST00000513509 | 211 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PANCR-202 | ENST00000513690 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-189P-201 | ENST00000516120 | 101 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1183P-201 | ENST00000517054 | 60 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC145141.2-201 | ENST00000518473 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000462.2-203 | ENST00000540545 | 715 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092747.1-202 | ENST00000540595 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02164-201 | ENST00000566684 | 272 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC011477.3-201 | ENST00000585571 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P10-201 | ENST00000605360 | 577 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP1B3P1-201 | ENST00000605365 | 821 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4458HG-202 | ENST00000605918 | 1057 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002044.1-201 | ENST00000606707 | 158 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.17-201 | ENST00000611454 | 95 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL031601.2-202 | ENST00000622650 | 282 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091953.5-201 | ENST00000622919 | 233 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073476.4-201 | ENST00000628409 | 72 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007218.2-201 | ENST00000636913 | 179 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LRRC70-201 | ENST00000334994 | 2249 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCLAF1P1-201 | ENST00000505813 | 2752 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EXOC6-203 | ENST00000371552 | 3564 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5AK2-201 | ENST00000326855 | 996 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.160-201 | ENST00000363677 | 92 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-658P-201 | ENST00000384606 | 106 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR518D-201 | ENST00000385014 | 87 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.19-201 | ENST00000390893 | 196 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-26P-201 | ENST00000410270 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPLP0P7-201 | ENST00000416050 | 667 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589987.2-201 | ENST00000417426 | 582 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245291.1-201 | ENST00000419501 | 328 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PSPC1-AS2-201 | ENST00000423023 | 376 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U51244.1-201 | ENST00000423120 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513185.2-201 | ENST00000425543 | 193 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007560.1-201 | ENST00000426912 | 237 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353705.1-201 | ENST00000433468 | 480 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL078601.1-201 | ENST00000444542 | 271 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P18-201 | ENST00000447010 | 465 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TH2LCRR-203 | ENST00000457489 | 439 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL807P-201 | ENST00000470923 | 297 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL442P-201 | ENST00000473804 | 320 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC126121.2-201 | ENST00000486137 | 698 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPRG-AS1-210 | ENST00000498655 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-143P-201 | ENST00000516296 | 146 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR892C-201 | ENST00000516410 | 77 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1314P-201 | ENST00000517139 | 104 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL7-206 | ENST00000520269 | 456 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022634.1-201 | ENST00000520765 | 532 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |