Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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