Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CITED1Q99966 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms