Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSNK2A3Q8NEV1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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