Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
HERC1Q15751 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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