Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHD3Q12873 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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CHD3Q12873 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
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CHD3Q12873 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
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CHD3Q12873 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.25
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CHD3Q12873 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHD3Q12873 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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