Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PUM3Q15397 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PUM3Q15397 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms