Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r10W4VSP8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms