Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms