Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17190V9GX38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms