Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm3839S4R1W1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3839S4R1W1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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