Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Knop1Q9Z2Q2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms