Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl27Q9Z1X0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms