Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs4Q9Z1T2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms