Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
D17h6s53eQ9Z1R4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms