Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms