Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setbp1Q9Z180 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setbp1Q9Z180 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms