Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup160Q9Z0W3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup160Q9Z0W3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms