Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms