Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cdh20Q9Z0M3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cdh20Q9Z0M3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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