Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn3Q9Z0G9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn3Q9Z0G9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms