Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PapolbQ9WVP6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms