Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms