Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx1Q9WV80 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx1Q9WV80 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms