Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VapaQ9WV55 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms