Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms