Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd3Q9WU40 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms