Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrf1Q9WU00 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms