Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms