Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PplQ9R269 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PplQ9R269 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PplQ9R269 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms