Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trpc2Q9R244 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms