Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms