Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms