Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr54Q9R0D8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms