Protein–RNA interactions for Protein: Q9R001

Adamts5, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 5, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts5Q9R001 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Adamts5Q9R001 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms